HW:ML、MP、NJ
隨意挑選10個NCBI上找到的RBR基因
先做Bioedit的clustal W
存檔之後，備份
接下來流程如下
將備份檔案名改為infile
先用seqboot 設定如下圖
得到oufile，隨後修改原本infile檔名為infile1
outfile改成infile
接下來用dnadist，完成NJ的部分
同樣得到outfile
將原本infile改成infile2
outfile改成infile
接下來用neighbor
修改data set為100
最後NJ結果如下: 打開Outfile(text)
打開outtree(treeview)
再來是ML和MP的部分
同樣用seqboot處理後
改用dnapars
得到一個outfile和outtree
然後把outtree改成intree
再使用consense
隨後，一樣可以得到一個outfile和outtree
沒有留言:
張貼留言